Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P63121 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms