Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2LP62875 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms