Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms