Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms