Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms