Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3AP57075 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms