Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD2BP57060 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms