Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52P55327 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52P55327 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52P55327 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52P55327 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52P55327 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52P55327 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52P55327 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52P55327 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52P55327 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52P55327 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52P55327 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52P55327 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52P55327 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52P55327 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52P55327 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52P55327 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52P55327 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52P55327 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52P55327 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52P55327 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52P55327 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52P55327 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52P55327 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52P55327 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52P55327 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52P55327 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52P55327 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52P55327 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52P55327 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52P55327 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52P55327 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52P55327 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52P55327 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPD52P55327 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPD52P55327 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPD52P55327 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPD52P55327 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPD52P55327 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPD52P55327 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPD52P55327 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPD52P55327 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPD52P55327 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPD52P55327 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPD52P55327 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPD52P55327 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPD52P55327 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPD52P55327 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPD52P55327 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPD52P55327 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPD52P55327 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPD52P55327 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPD52P55327 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPD52P55327 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPD52P55327 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPD52P55327 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPD52P55327 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPD52P55327 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TPD52P55327 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPD52P55327 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPD52P55327 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPD52P55327 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPD52P55327 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPD52P55327 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms