Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP12AP54707 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms