Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	FAP7	YDL166C	594 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	DPB4	YDR121W	591 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	HDA2	YDR295C	2025 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YGR111W	YGR111W	1203 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	AHP1	YLR109W	531 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	COQ5	YML110C	924 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	AIP1	YMR092C	1848 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	RPS7A	YOR096W	573 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YBR242W	YBR242W	717 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	ARO4	YBR249C	1113 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	POL2	YNL262W	6669 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	ROD1	YOR018W	2514 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	CEX1	YOR112W	2286 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	SDS23	YGL056C	1584 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	MAK11	YKL021C	1407 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	TMA17	YDL110C	453 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YEL032C-A	YEL032C-A	162 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	SEC28	YIL076W	891 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	DLS1	YJL065C	504 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	LSM1	YJL124C	519 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	TRM112	YNR046W	408 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	DDP1	YOR163W	567 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YOR238W	YOR238W	912 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	PDR12	YPL058C	4536 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	ENA2	YDR039C	3276 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	ENA1	YDR040C	3276 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	GLC3	YEL011W	2115 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	EPO1	YMR124W	2832 nt		3.56	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	DSL1	YNL258C	2265 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	SLI1	YGR212W	1407 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	ALG1	YBR110W	1350 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	SLS1	YLR139C	1932 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	NHP10	YDL002C	612 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	ERG25	YGR060W	930 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	COX3	Q0275	810 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	DPH1	YIL103W	1278 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	GTT1	YIR038C	705 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YAL066W	YAL066W	309 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YLR366W	YLR366W	306 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YPT7	YML001W	627 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	SSO2	YMR183C	888 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YNL057W	YNL057W	333 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	TYE7	YOR344C	876 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	SUR1	YPL057C	1149 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YPR108W-A	YPR108W-A	213 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	PIN3	YPR154W	648 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	snR44	snR44	211 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	SKN7	YHR206W	1869 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	RRP5	YMR229C	5190 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	PPQ1	YPL179W	1650 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	FRE4	YNR060W	2160 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	PBI1	YPL272C	1554 nt		3.55	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	TAF1	YGR274C	3201 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	HSE1	YHL002W	1359 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YHR202W	YHR202W	1809 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YCR100C	YCR100C	951 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	AAD3	YCR107W	1092 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	tX(XXX)D	tX(XXX)D	100 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YAL004W	YAL004W	648 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	PSF2	YJL072C	642 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	CDC8	YJR057W	651 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YMR099C	YMR099C	894 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YPR078C	YPR078C	1119 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	SEC59	YMR013C	1560 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	RRN7	YJL025W	1545 nt		3.54	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	ECM18	YDR125C	1362 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YSP2	YDR326C	4317 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YPR148C	YPR148C	1308 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	CDC45	YLR103C	1953 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	TRS120	YDR407C	3870 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	TSC13	YDL015C	933 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	SNU23	YDL098C	585 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YDL242W	YDL242W	354 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	IRC22	YEL001C	678 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	UBC8	YEL012W	657 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YGR026W	YGR026W	837 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YPT35	YHR105W	645 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	IZH2	YOL002C	954 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YOR082C	YOR082C	342 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	HAT1	YPL001W	1125 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	AEP3	YPL005W	1821 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	CTM1	YHR109W	1758 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	TCB3	YML072C	4638 nt		3.53	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	SSU1	YPL092W	1377 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YOR365C	YOR365C	2112 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	RFA3	YJL173C	369 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YKR070W	YKR070W	1059 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YOR062C	YOR062C	807 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YOR097C	YOR097C	528 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	RPB8	YOR224C	441 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	SLM4	YBR077C	489 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	ERV15	YBR210W	429 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	RIB5	YBR256C	717 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	POF1	YCL047C	777 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	UTP25	YIL091C	2166 nt		3.52	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	RDS1	YCR106W	2499 nt		3.51	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	DSS1	YMR287C	2910 nt		3.51	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	PGS1	YCL004W	1566 nt		3.51	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	SAD1	YFR005C	1347 nt		3.51	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YGL117W	YGL117W	798 nt		3.51	□□□□□ -1.85

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