Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC3P51654 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC3P51654 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC3P51654 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC3P51654 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC3P51654 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC3P51654 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC3P51654 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC3P51654 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC3P51654 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC3P51654 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC3P51654 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC3P51654 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC3P51654 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC3P51654 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC3P51654 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC3P51654 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC3P51654 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC3P51654 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC3P51654 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC3P51654 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC3P51654 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC3P51654 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC3P51654 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC3P51654 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC3P51654 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC3P51654 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC3P51654 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC3P51654 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC3P51654 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC3P51654 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC3P51654 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC3P51654 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC3P51654 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC3P51654 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC3P51654 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC3P51654 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC3P51654 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC3P51654 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC3P51654 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC3P51654 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC3P51654 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC3P51654 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC3P51654 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC3P51654 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC3P51654 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC3P51654 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC3P51654 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC3P51654 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC3P51654 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC3P51654 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC3P51654 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC3P51654 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC3P51654 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC3P51654 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPC3P51654 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPC3P51654 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPC3P51654 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPC3P51654 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC3P51654 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC3P51654 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC3P51654 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC3P51654 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC3P51654 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC3P51654 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC3P51654 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC3P51654 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC3P51654 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC3P51654 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC3P51654 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC3P51654 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC3P51654 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC3P51654 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC3P51654 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC3P51654 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC3P51654 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC3P51654 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC3P51654 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC3P51654 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC3P51654 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC3P51654 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC3P51654 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms