Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
SMARCA4P51532 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SMARCA4P51532 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms