Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms