Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms