Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC1P48995 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms