Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA1P46926 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA1P46926 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA1P46926 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA1P46926 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA1P46926 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GNPDA1P46926 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GNPDA1P46926 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GNPDA1P46926 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GNPDA1P46926 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GNPDA1P46926 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GNPDA1P46926 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GNPDA1P46926 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GNPDA1P46926 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GNPDA1P46926 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms