Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms