Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF9P41273 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF9P41273 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms