Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPHP41219 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPHP41219 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPHP41219 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPHP41219 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPHP41219 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPHP41219 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPHP41219 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPHP41219 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPHP41219 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPHP41219 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPHP41219 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPHP41219 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPHP41219 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPHP41219 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPHP41219 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPHP41219 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPHP41219 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPHP41219 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPHP41219 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPHP41219 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPHP41219 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPHP41219 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPHP41219 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPHP41219 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPHP41219 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPHP41219 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPHP41219 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPHP41219 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPHP41219 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPHP41219 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPHP41219 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPHP41219 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPHP41219 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPHP41219 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPHP41219 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPHP41219 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPHP41219 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPHP41219 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPHP41219 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPHP41219 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPHP41219 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPHP41219 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPHP41219 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPHP41219 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPHP41219 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPHP41219 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPHP41219 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPHP41219 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPHP41219 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPHP41219 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPHP41219 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPHP41219 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPHP41219 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPHP41219 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPHP41219 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPHP41219 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPHP41219 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPHP41219 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPHP41219 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPHP41219 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPHP41219 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPHP41219 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPHP41219 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPHP41219 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPHP41219 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms