Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YML053CYML053C 639 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 MRPL16YBL038W 699 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 FMP41YNL168C 780 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 SPR2YOR214C 711 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RPS11BYBR048W 471 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 CIN2YPL241C 807 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 MUD1YBR119W 897 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 GAC1YOR178C 2382 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 GCN5YGR252W 1320 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 AIM21YIR003W 2040 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 OSH3YHR073W 2991 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 PHM7YOL084W 2976 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YEH2YLR020C 1617 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 BMS1YPL217C 3552 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 CRD1YDL142C 852 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 MPO1YGL010W 525 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 GEP4YHR100C 558 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 IKI1YHR187W 930 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 GCD14YJL125C 1152 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 BAT2YJR148W 1131 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 NYV1YLR093C 762 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 MRPL17YNL252C 846 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RPS19AYOL121C 435 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 SYC1YOR179C 567 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RRG7YOR305W 729 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 SNF8YPL002C 702 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YPL278CYPL278C 303 nt3.34□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YJR030CYJR030C 2238 nt3.34□□□□□ -1.88
AVT5P38176 DSL1YNL258C 2265 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 CHL1YPL008W 2586 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 SAF1YBR280C 1914 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 snR56snR56 88 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 BTT1YDR252W 450 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YFH7YFR007W 1062 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YGR064WYGR064W 369 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 RPL27AYHR010W 411 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 EFB1YAL003W 621 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 MET14YKL001C 609 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YPT6YLR262C 648 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YMR010WYMR010W 1218 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YNR042WYNR042W 429 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 HSH49YOR319W 642 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 HPA2YPR193C 471 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 PRP3YDR473C 1410 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YLR352WYLR352W 2424 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 APN2YBL019W 1563 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 LYP1YNL268W 1836 nt3.33□□□□□ -1.88
AVT5P38176 UBP12YJL197W 3765 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 TLG1YDR468C 675 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 EMC4YGL231C 573 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 FOL2YGR267C 732 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 GLG2YJL137C 1143 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 PAM18YLR008C 507 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YAR070CYAR070C 300 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YLR379WYLR379W 375 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 RUF22RUF22 515 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 RPL18BYNL301C 561 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YOR238WYOR238W 912 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 HUT1YPL244C 1020 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YPR147CYPR147C 915 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 FRM2YCL026C-A 582 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 TRM11YOL124C 1302 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 RPO21YDL140C 5202 nt3.32□□□□□ -1.88
AVT5P38176 GEM1YAL048C 1989 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 MRS2YOR334W 1413 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 MTH1YDR277C 1302 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 RXT3YDL076C 885 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 PET100YDR079W 336 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 RPS18AYDR450W 441 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 PRE1YER012W 597 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YOS1YER074W-A 258 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YGL242CYGL242C 546 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 PEX18YHR160C 852 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 MMF1YIL051C 438 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YJL147CYJL147C 1149 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 AIM25YJR100C 984 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 MED11YMR112C 396 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 RAD14YMR201C 1116 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 RRT1YBL048W 312 nt3.31□□□□□ -1.88
AVT5P38176 DSS1YMR287C 2910 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 DSN1YIR010W 1731 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YOL019WYOL019W 1656 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 CET1YPL228W 1650 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 BI3Q0115 1554 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 URK1YNR012W 1506 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 ACA1YER045C 1470 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 UBC9YDL064W 474 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 UBC8YEL012W 657 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YER034WYER034W 558 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 THP2YHR167W 786 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 PPX1YHR201C 1194 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 APQ13YJL075C 417 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 MRPL49YJL096W 486 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YOR364WYOR364W 369 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YOR379CYOR379C 339 nt3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.3 ms