Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms