Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms