Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRS3P32247 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRS3P32247 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRS3P32247 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRS3P32247 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRS3P32247 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRS3P32247 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRS3P32247 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRS3P32247 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRS3P32247 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRS3P32247 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRS3P32247 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRS3P32247 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRS3P32247 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BRS3P32247 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRS3P32247 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRS3P32247 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRS3P32247 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRS3P32247 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRS3P32247 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRS3P32247 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRS3P32247 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRS3P32247 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRS3P32247 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRS3P32247 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRS3P32247 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BRS3P32247 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRS3P32247 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRS3P32247 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRS3P32247 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRS3P32247 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRS3P32247 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRS3P32247 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRS3P32247 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRS3P32247 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRS3P32247 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRS3P32247 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRS3P32247 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRS3P32247 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRS3P32247 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRS3P32247 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRS3P32247 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRS3P32247 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRS3P32247 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRS3P32247 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRS3P32247 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRS3P32247 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRS3P32247 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRS3P32247 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRS3P32247 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRS3P32247 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRS3P32247 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BRS3P32247 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms