Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPOP30536 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPOP30536 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPOP30536 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPOP30536 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPOP30536 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPOP30536 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPOP30536 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPOP30536 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPOP30536 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPOP30536 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPOP30536 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPOP30536 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPOP30536 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPOP30536 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPOP30536 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPOP30536 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPOP30536 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPOP30536 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPOP30536 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPOP30536 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPOP30536 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPOP30536 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPOP30536 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPOP30536 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPOP30536 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPOP30536 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPOP30536 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPOP30536 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPOP30536 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPOP30536 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPOP30536 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPOP30536 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPOP30536 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms