Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
POLD1P28340 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLD1P28340 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLD1P28340 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLD1P28340 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD1P28340 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD1P28340 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD1P28340 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD1P28340 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD1P28340 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD1P28340 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD1P28340 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD1P28340 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD1P28340 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD1P28340 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD1P28340 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD1P28340 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD1P28340 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD1P28340 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD1P28340 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD1P28340 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD1P28340 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD1P28340 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD1P28340 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD1P28340 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD1P28340 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD1P28340 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD1P28340 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD1P28340 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD1P28340 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD1P28340 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD1P28340 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLD1P28340 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLD1P28340 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLD1P28340 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLD1P28340 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLD1P28340 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLD1P28340 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLD1P28340 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLD1P28340 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLD1P28340 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLD1P28340 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLD1P28340 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLD1P28340 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLD1P28340 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
POLD1P28340 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLD1P28340 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLD1P28340 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLD1P28340 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLD1P28340 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLD1P28340 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLD1P28340 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLD1P28340 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLD1P28340 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLD1P28340 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLD1P28340 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLD1P28340 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLD1P28340 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLD1P28340 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLD1P28340 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
POLD1P28340 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLD1P28340 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLD1P28340 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLD1P28340 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLD1P28340 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLD1P28340 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
POLD1P28340 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27■■□□□ 1.91
POLD1P28340 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLD1P28340 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLD1P28340 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLD1P28340 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLD1P28340 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLD1P28340 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLD1P28340 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLD1P28340 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLD1P28340 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLD1P28340 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLD1P28340 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLD1P28340 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLD1P28340 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POLD1P28340 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLD1P28340 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLD1P28340 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLD1P28340 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLD1P28340 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POLD1P28340 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLD1P28340 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLD1P28340 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD1P28340 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD1P28340 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD1P28340 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD1P28340 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD1P28340 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD1P28340 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD1P28340 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD1P28340 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD1P28340 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD1P28340 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD1P28340 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD1P28340 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms