Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBG1P23258 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms