Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DPA1P20036 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms