Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD58P19256 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD58P19256 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD58P19256 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD58P19256 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD58P19256 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD58P19256 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD58P19256 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD58P19256 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD58P19256 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD58P19256 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD58P19256 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD58P19256 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD58P19256 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD58P19256 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CD58P19256 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD58P19256 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD58P19256 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD58P19256 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD58P19256 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD58P19256 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD58P19256 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD58P19256 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD58P19256 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD58P19256 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD58P19256 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD58P19256 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD58P19256 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD58P19256 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD58P19256 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD58P19256 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD58P19256 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD58P19256 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD58P19256 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD58P19256 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD58P19256 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD58P19256 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD58P19256 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD58P19256 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD58P19256 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD58P19256 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CD58P19256 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD58P19256 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD58P19256 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD58P19256 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD58P19256 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CD58P19256 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD58P19256 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD58P19256 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD58P19256 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD58P19256 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD58P19256 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD58P19256 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD58P19256 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD58P19256 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD58P19256 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD58P19256 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD58P19256 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD58P19256 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD58P19256 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD58P19256 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD58P19256 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms