Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6P18850 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6P18850 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATF6P18850 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6P18850 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6P18850 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6P18850 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6P18850 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6P18850 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6P18850 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6P18850 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6P18850 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6P18850 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6P18850 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6P18850 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6P18850 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6P18850 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6P18850 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6P18850 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6P18850 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6P18850 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6P18850 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6P18850 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6P18850 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6P18850 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6P18850 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6P18850 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6P18850 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6P18850 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6P18850 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6P18850 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6P18850 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6P18850 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6P18850 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms