Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMD1P17707 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMD1P17707 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMD1P17707 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMD1P17707 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMD1P17707 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMD1P17707 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMD1P17707 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMD1P17707 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMD1P17707 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMD1P17707 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMD1P17707 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMD1P17707 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMD1P17707 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMD1P17707 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMD1P17707 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMD1P17707 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMD1P17707 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMD1P17707 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
AMD1P17707 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMD1P17707 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMD1P17707 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMD1P17707 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMD1P17707 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AMD1P17707 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMD1P17707 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMD1P17707 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMD1P17707 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMD1P17707 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMD1P17707 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMD1P17707 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMD1P17707 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMD1P17707 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMD1P17707 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMD1P17707 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMD1P17707 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMD1P17707 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMD1P17707 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMD1P17707 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMD1P17707 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AMD1P17707 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMD1P17707 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
AMD1P17707 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMD1P17707 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMD1P17707 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMD1P17707 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMD1P17707 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMD1P17707 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMD1P17707 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AMD1P17707 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMD1P17707 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMD1P17707 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMD1P17707 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMD1P17707 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMD1P17707 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMD1P17707 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMD1P17707 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMD1P17707 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMD1P17707 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMD1P17707 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMD1P17707 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMD1P17707 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms