Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSCAN20P17040 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZSCAN20P17040 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZSCAN20P17040 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSCAN20P17040 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSCAN20P17040 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSCAN20P17040 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSCAN20P17040 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSCAN20P17040 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSCAN20P17040 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms