Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCL3L1P16619 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms