Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB1P16220 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB1P16220 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB1P16220 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB1P16220 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB1P16220 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB1P16220 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB1P16220 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB1P16220 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB1P16220 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB1P16220 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB1P16220 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB1P16220 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB1P16220 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB1P16220 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB1P16220 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB1P16220 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB1P16220 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB1P16220 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB1P16220 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB1P16220 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB1P16220 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB1P16220 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB1P16220 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB1P16220 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB1P16220 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB1P16220 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB1P16220 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB1P16220 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB1P16220 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB1P16220 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB1P16220 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB1P16220 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB1P16220 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB1P16220 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB1P16220 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB1P16220 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB1P16220 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB1P16220 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB1P16220 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB1P16220 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms