Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF3P15923 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF3P15923 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF3P15923 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF3P15923 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF3P15923 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF3P15923 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF3P15923 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF3P15923 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF3P15923 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF3P15923 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF3P15923 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF3P15923 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF3P15923 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF3P15923 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF3P15923 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF3P15923 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF3P15923 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF3P15923 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF3P15923 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF3P15923 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF3P15923 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF3P15923 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF3P15923 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF3P15923 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF3P15923 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF3P15923 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF3P15923 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF3P15923 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF3P15923 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF3P15923 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF3P15923 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF3P15923 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF3P15923 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF3P15923 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF3P15923 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF3P15923 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF3P15923 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF3P15923 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF3P15923 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF3P15923 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF3P15923 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF3P15923 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF3P15923 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF3P15923 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF3P15923 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF3P15923 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF3P15923 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF3P15923 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF3P15923 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF3P15923 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF3P15923 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF3P15923 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF3P15923 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF3P15923 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF3P15923 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF3P15923 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF3P15923 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF3P15923 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF3P15923 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF3P15923 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF3P15923 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF3P15923 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF3P15923 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF3P15923 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF3P15923 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF3P15923 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF3P15923 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF3P15923 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms