Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VAV1P15498 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAV1P15498 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAV1P15498 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAV1P15498 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAV1P15498 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAV1P15498 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAV1P15498 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAV1P15498 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAV1P15498 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAV1P15498 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VAV1P15498 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAV1P15498 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAV1P15498 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAV1P15498 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAV1P15498 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAV1P15498 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAV1P15498 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VAV1P15498 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAV1P15498 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAV1P15498 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAV1P15498 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAV1P15498 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAV1P15498 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAV1P15498 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAV1P15498 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAV1P15498 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAV1P15498 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAV1P15498 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAV1P15498 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VAV1P15498 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAV1P15498 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAV1P15498 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAV1P15498 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VAV1P15498 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAV1P15498 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAV1P15498 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAV1P15498 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAV1P15498 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAV1P15498 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAV1P15498 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAV1P15498 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAV1P15498 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAV1P15498 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VAV1P15498 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAV1P15498 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAV1P15498 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAV1P15498 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms