Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LCP1P13796 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LCP1P13796 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LCP1P13796 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCP1P13796 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LCP1P13796 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCP1P13796 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCP1P13796 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCP1P13796 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LCP1P13796 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCP1P13796 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCP1P13796 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCP1P13796 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCP1P13796 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCP1P13796 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCP1P13796 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LCP1P13796 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCP1P13796 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCP1P13796 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCP1P13796 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCP1P13796 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCP1P13796 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCP1P13796 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCP1P13796 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCP1P13796 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCP1P13796 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCP1P13796 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCP1P13796 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LCP1P13796 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCP1P13796 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LCP1P13796 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCP1P13796 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCP1P13796 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms