Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MS4A1P11836 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms