Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1P11387 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1P11387 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1P11387 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1P11387 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1P11387 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1P11387 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1P11387 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1P11387 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1P11387 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1P11387 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOP1P11387 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOP1P11387 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOP1P11387 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOP1P11387 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOP1P11387 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOP1P11387 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1P11387 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1P11387 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1P11387 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1P11387 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1P11387 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1P11387 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1P11387 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1P11387 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1P11387 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1P11387 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1P11387 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1P11387 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1P11387 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1P11387 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1P11387 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1P11387 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1P11387 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1P11387 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1P11387 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1P11387 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1P11387 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1P11387 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1P11387 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1P11387 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1P11387 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1P11387 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1P11387 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1P11387 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1P11387 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1P11387 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1P11387 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1P11387 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1P11387 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1P11387 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1P11387 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1P11387 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1P11387 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1P11387 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP1P11387 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP1P11387 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP1P11387 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP1P11387 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP1P11387 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP1P11387 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP1P11387 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP1P11387 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP1P11387 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP1P11387 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP1P11387 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP1P11387 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP1P11387 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP1P11387 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP1P11387 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP1P11387 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP1P11387 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP1P11387 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOP1P11387 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOP1P11387 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOP1P11387 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOP1P11387 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1P11387 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1P11387 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1P11387 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1P11387 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms