Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB1P11230 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms