Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms