Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HKR1P10072 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HKR1P10072 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HKR1P10072 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HKR1P10072 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HKR1P10072 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HKR1P10072 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HKR1P10072 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HKR1P10072 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HKR1P10072 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HKR1P10072 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HKR1P10072 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HKR1P10072 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HKR1P10072 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HKR1P10072 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HKR1P10072 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HKR1P10072 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HKR1P10072 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HKR1P10072 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HKR1P10072 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HKR1P10072 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HKR1P10072 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms