Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETSIPP0DME0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms