Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms