Protein–RNA interactions for Protein: P0CI26

TRIM49C, Tripartite motif-containing protein 49C, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49CP0CI26 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49CP0CI26 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms