Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00869P0C866 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00869P0C866 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00869P0C866 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00869P0C866 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00869P0C866 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00869P0C866 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00869P0C866 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00869P0C866 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00869P0C866 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00869P0C866 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00869P0C866 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00869P0C866 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00869P0C866 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00869P0C866 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00869P0C866 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00869P0C866 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms