Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PKHD1P08F94 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms