Protein–RNA interactions for Protein: P08670

VIM, Vimentin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIMP08670 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIMP08670 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIMP08670 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIMP08670 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIMP08670 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIMP08670 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIMP08670 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIMP08670 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIMP08670 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VIMP08670 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIMP08670 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIMP08670 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIMP08670 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIMP08670 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIMP08670 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIMP08670 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIMP08670 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIMP08670 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIMP08670 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIMP08670 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIMP08670 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIMP08670 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIMP08670 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIMP08670 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIMP08670 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIMP08670 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIMP08670 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIMP08670 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIMP08670 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIMP08670 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIMP08670 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIMP08670 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIMP08670 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIMP08670 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIMP08670 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIMP08670 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms