Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGAP02671 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGAP02671 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGAP02671 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGAP02671 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FGAP02671 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGAP02671 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGAP02671 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGAP02671 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGAP02671 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGAP02671 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGAP02671 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGAP02671 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGAP02671 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGAP02671 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGAP02671 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGAP02671 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGAP02671 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGAP02671 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGAP02671 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGAP02671 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGAP02671 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGAP02671 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGAP02671 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGAP02671 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGAP02671 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGAP02671 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGAP02671 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGAP02671 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGAP02671 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGAP02671 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FGAP02671 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGAP02671 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGAP02671 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGAP02671 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGAP02671 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGAP02671 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGAP02671 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGAP02671 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGAP02671 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGAP02671 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGAP02671 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGAP02671 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGAP02671 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGAP02671 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGAP02671 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGAP02671 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FGAP02671 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGAP02671 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGAP02671 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGAP02671 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGAP02671 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGAP02671 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGAP02671 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGAP02671 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGAP02671 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FGAP02671 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FGAP02671 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGAP02671 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGAP02671 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FGAP02671 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGAP02671 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGAP02671 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGAP02671 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGAP02671 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGAP02671 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGAP02671 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGAP02671 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGAP02671 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGAP02671 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGAP02671 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGAP02671 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGAP02671 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGAP02671 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGAP02671 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGAP02671 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGAP02671 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGAP02671 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGAP02671 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGAP02671 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGAP02671 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms