Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSP01100 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSP01100 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSP01100 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSP01100 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSP01100 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSP01100 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOSP01100 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOSP01100 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSP01100 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSP01100 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSP01100 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSP01100 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSP01100 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSP01100 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSP01100 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSP01100 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSP01100 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOSP01100 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSP01100 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSP01100 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSP01100 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSP01100 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSP01100 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSP01100 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSP01100 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSP01100 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSP01100 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSP01100 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOSP01100 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOSP01100 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOSP01100 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSP01100 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSP01100 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSP01100 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSP01100 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSP01100 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSP01100 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOSP01100 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSP01100 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSP01100 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSP01100 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSP01100 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSP01100 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSP01100 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSP01100 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSP01100 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSP01100 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOSP01100 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSP01100 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSP01100 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSP01100 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSP01100 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSP01100 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSP01100 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSP01100 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSP01100 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOSP01100 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSP01100 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSP01100 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSP01100 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSP01100 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSP01100 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSP01100 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSP01100 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSP01100 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSP01100 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSP01100 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms