Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA3O96018 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA3O96018 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA3O96018 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA3O96018 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA3O96018 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA3O96018 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA3O96018 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA3O96018 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA3O96018 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA3O96018 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA3O96018 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
APBA3O96018 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA3O96018 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA3O96018 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA3O96018 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA3O96018 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA3O96018 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA3O96018 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA3O96018 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA3O96018 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA3O96018 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA3O96018 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA3O96018 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA3O96018 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA3O96018 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA3O96018 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA3O96018 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA3O96018 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA3O96018 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA3O96018 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA3O96018 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA3O96018 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA3O96018 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA3O96018 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA3O96018 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA3O96018 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA3O96018 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA3O96018 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA3O96018 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APBA3O96018 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APBA3O96018 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APBA3O96018 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APBA3O96018 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APBA3O96018 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APBA3O96018 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APBA3O96018 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APBA3O96018 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APBA3O96018 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APBA3O96018 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APBA3O96018 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APBA3O96018 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APBA3O96018 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APBA3O96018 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APBA3O96018 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
APBA3O96018 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APBA3O96018 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APBA3O96018 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APBA3O96018 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APBA3O96018 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA3O96018 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA3O96018 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA3O96018 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA3O96018 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA3O96018 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA3O96018 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA3O96018 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA3O96018 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA3O96018 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA3O96018 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA3O96018 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA3O96018 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA3O96018 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA3O96018 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBA3O96018 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBA3O96018 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBA3O96018 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBA3O96018 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBA3O96018 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBA3O96018 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBA3O96018 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBA3O96018 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBA3O96018 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBA3O96018 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBA3O96018 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBA3O96018 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APBA3O96018 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA3O96018 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA3O96018 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA3O96018 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA3O96018 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA3O96018 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA3O96018 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA3O96018 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA3O96018 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA3O96018 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA3O96018 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA3O96018 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA3O96018 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA3O96018 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms